Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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TRIM63Q969Q1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIM63Q969Q1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
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