Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TOP1MTQ969P6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TOP1MTQ969P6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
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