Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HPS3Q969F9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HPS3Q969F9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms