Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSC1Q92574 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TSC1Q92574 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms