Protein–RNA interactions for Protein: Q92563

SPOCK2, Testican-2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK2Q92563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPOCK2Q92563 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPOCK2Q92563 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms