Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPDL3BQ92485 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPDL3BQ92485 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms