Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DDB2Q92466 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DDB2Q92466 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms