Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG4AQ8WYN0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ATG4AQ8WYN0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ATG4AQ8WYN0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms