Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW33

GTSF1, Gametocyte-specific factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSF1Q8WW33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTSF1Q8WW33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GTSF1Q8WW33 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms