Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRN4Q8WUT4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRN4Q8WUT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms