Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSC4DQ8WTU2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSC4DQ8WTU2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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