Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HAVCR2Q8TDQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HAVCR2Q8TDQ0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms