Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HELQQ8TDG4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HELQQ8TDG4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 310.6 ms