Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF398Q8TD17 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF398Q8TD17 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF398Q8TD17 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms