Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 44.1
PUM2Q8TB72 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-8■■■■■ 44.1
PUM2Q8TB72 TET2-201ENST00000265149 9588 ntTSL 55.54□□□□□ -1.523e-8■■■■■ 44.1
PUM2Q8TB72 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.613e-8■■■■■ 44.1
PUM2Q8TB72 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.273e-16■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 POM121C-207ENST00000614583 4073 ntTSL 213.44□□□□□ -0.263e-16■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.763e-12■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.853e-12■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 WDR91-204ENST00000466182 3594 ntTSL 29.34□□□□□ -0.913e-12■■■■■ 44
PUM2Q8TB72 CLIP1-219ENST00000620786 5913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 CLIP1-203ENST00000361654 5568 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 CLIP1-201ENST00000302528 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-8■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 CLIP1-218ENST00000545889 4633 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.15e-8■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.373e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PHF20L1-211ENST00000460236 3393 ntTSL 55.42□□□□□ -1.543e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.733e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PHF20L1-213ENST00000477051 3293 ntTSL 22.18□□□□□ -2.063e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-201ENST00000296302 5145 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-205ENST00000409057 4980 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-208ENST00000410007 4905 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-209ENST00000412587 4766 ntTSL 1 (best)8.15□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-206ENST00000409114 5015 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.141e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-220ENST00000480064 919 ntTSL 1 (best)7.75□□□□□ -1.171e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-215ENST00000446103 3256 ntTSL 26.84□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.371e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PBRM1-211ENST00000423351 4385 ntTSL 54.94□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 PITPNB-201ENST00000320996 2826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-10■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 43.8
PUM2Q8TB72 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.213e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 ARHGEF19-205ENST00000478117 2035 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.275e-7■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 KCNAB2-206ENST00000378097 4201 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.452e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 KCNAB2-201ENST00000164247 4273 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 KCNAB2-203ENST00000352527 4165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 43.7
PUM2Q8TB72 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 USP33-209ENST00000481579 2866 ntTSL 25.37□□□□□ -1.551e-9■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.851e-9■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-6■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.749e-10■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.189e-10■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 FBRS-208ENST00000543786 2890 ntTSL 213.65□□□□□ -0.229e-10■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 FBRS-206ENST00000494101 2782 ntTSL 213.07□□□□□ -0.329e-10■■■■■ 43.6
PUM2Q8TB72 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.215e-15■■■■■ 43.5
PUM2Q8TB72 SECISBP2L-201ENST00000261847 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 43.4
PUM2Q8TB72 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-18■■■■■ 43.4
PUM2Q8TB72 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -16e-21■■■■■ 43.4
PUM2Q8TB72 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.014e-8■■■■■ 43.4
PUM2Q8TB72 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.774e-8■■■■■ 43.4
PUM2Q8TB72 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.222e-19■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.382e-19■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.382e-19■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-19■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.32□□□□□ -2.041e-10■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.022e-80■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.532e-80■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DAD1-204ENST00000538631 441 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -12e-80■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 DAD1-203ENST00000535847 591 ntTSL 28.34□□□□□ -1.072e-80■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.931e-9■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 KCNK1-201ENST00000366620 2086 ntTSL 211.24□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 43.3
PUM2Q8TB72 EPB41L4A-AS1-202ENST00000427306 1367 ntTSL 222.22■■□□□ 1.151e-323■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 EPB41L4A-AS1-203ENST00000442823 578 ntTSL 215.65■□□□□ 0.11e-323■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-323■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 EPB41L4A-AS1-204ENST00000508590 292 ntTSL 314.1□□□□□ -0.151e-323■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.997e-9■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.036e-15■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 AF241726.2-201ENST00000465127 954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.066e-15■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.919e-8■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.449e-8■■■■■ 43.2
PUM2Q8TB72 IPO5-202ENST00000357602 4335 ntAPPRIS P1 TSL 511.83□□□□□ -0.522e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 IPO5-208ENST00000469360 3505 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.242e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 25.24□□□□□ -1.572e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.662e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 IPO5-207ENST00000468620 480 ntTSL 24.62□□□□□ -1.672e-34■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.711e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.681e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 43.1
PUM2Q8TB72 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 43.1
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