Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GSDMBQ8TAX9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMBQ8TAX9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms