Protein–RNA interactions for Protein: Q8NER5

ACVR1C, Activin receptor type-1C, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1CQ8NER5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ACVR1CQ8NER5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACVR1CQ8NER5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms