Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AVL9Q8NBF6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AVL9Q8NBF6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AVL9Q8NBF6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms