Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC29Q8NA56 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TTC29Q8NA56 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms