Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
FSIP1Q8NA03 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FSIP1Q8NA03 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FSIP1Q8NA03 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms