Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MSL3Q8N5Y2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSL3Q8N5Y2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSL3Q8N5Y2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms