Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00269Q8N2A0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00269Q8N2A0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms