Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMNTD2Q8IXW0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LMNTD2Q8IXW0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms