Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM50Q86XT4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIM50Q86XT4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM50Q86XT4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms