Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SKAP1Q86WV1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SKAP1Q86WV1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SKAP1Q86WV1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms