Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
N4BP2Q86UW6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
N4BP2Q86UW6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
N4BP2Q86UW6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms