Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMC1Q7Z7K0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMC1Q7Z7K0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms