Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
KRT27Q7Z3Y8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT27Q7Z3Y8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms