Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
UBE3BQ7Z3V4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBE3BQ7Z3V4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBE3BQ7Z3V4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms