Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC46A3Q7Z3Q1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC46A3Q7Z3Q1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms