Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
APTXQ7Z2E3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
APTXQ7Z2E3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APTXQ7Z2E3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms