Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NLRP9Q7RTR0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NLRP9Q7RTR0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms