Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RUFY3Q7L099 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUFY3Q7L099 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUFY3Q7L099 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms