Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HECW1Q76N89 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HECW1Q76N89 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HECW1Q76N89 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HECW1Q76N89 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms