Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP43Q70EL4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
USP43Q70EL4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms