Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYDE1Q6ZW31 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms