Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM47EQ6ZV65 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM47EQ6ZV65 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms