Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC00173Q6ZV60 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00173Q6ZV60 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms