Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM136Q6ZRR5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM136Q6ZRR5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms