Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLCO4C1Q6ZQN7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLCO4C1Q6ZQN7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms