Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM72Q6ZMU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM72Q6ZMU5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM72Q6ZMU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms