Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCBE1Q6UXH8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCBE1Q6UXH8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms