Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC4A10Q6U841 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC4A10Q6U841 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC4A10Q6U841 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms