Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMARCD3Q6STE5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMARCD3Q6STE5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms