Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC137Q6PK04 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC137Q6PK04 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC137Q6PK04 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms