Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTC41PQ6P2S7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTC41PQ6P2S7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms