Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC27A4Q6P1M0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC27A4Q6P1M0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms