Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAVIN1Q6NZI2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.7 ms