Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
JMJD6Q6NYC1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
JMJD6Q6NYC1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms