Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IRGCQ6NXR0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IRGCQ6NXR0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms